Träger
Die Filderklinik ist eine gemeinnützige GmbH. Gesellschafter sind die Mahlestiftung gGmbH, der Verein Filderklinik e.V. und der Verein zur Förderung der Filderklinik in Filderstadt e.V.
Diese drei Gesellschafter haben jeweils einen besonderen Bezug zur Filderklinik. Den Begründern der Firma Mahle und der aus ihr hervorgegangenen Mahlestiftung ist es zu verdanken, dass die Filderklinik überhaupt gebaut werden konnte. Seither fördert die Mahlestiftung die Besonderheiten der anthroposophischen Medizin mit großem Engagement.
Der Verein Filderklinik e.V. ist der Eigentümer der Gebäude. Er fördert darüber hinaus einen beträchtlichen Anteil der Forschung in der Filderklinik.
Der Verein zur Förderung der Filderklinik e.V. besteht aus Mitarbeitern sowie Freunden und Unterstützern der Filderklinik. Viele ehemalige Patienten sind bereits Mitglieder geworden.
Die Mitglieder des Aufsichtsrats sind als Vorsitzender Josef R. Vogel, Dr. Jürgen Schürholz, Mitbegründer der Filderklinik, Mitglied im Beirat der Mahle-Stiftung, Peter Zimmermann, Vorstand am Gemeinschaftskrankenhaus Herdecke, Dr. med. Dietrich Schlodder und Dr. med. Wolfgang Schuster.
Interne Struktur
Dem Geschäftsführer steht eine dreiköpfige Klinikleitung beratend zur Seite. Ihr gehören ein Leitender Arzt/Ärztlicher Direktor, der Pflegedienstleiter, sowie eine Therapeutin an.

- Volker Ernst

- Pirkko Ollilainen

- Martin Höfflin

- Dr. med. Bernd Voggenreiter
Die Leitenden Ärzte tragen die Verantwortung für ihre Abteilungen. Auch allen Berufsgruppen des Krankenhauses stehen Abteilungsleiter vor. Jede Pflegegruppe wird durch eine Gruppenleitung verantwortet.
In der Klinikkonferenz treffen sich alle Abteilungsleiter und beraten die Dinge, die alle betreffen, wie zum Beispiel die monatlichen Leistungszahlen.
Der Vertrauenskreis, der die Aufgabe eines Betriebsrates inne hat, vertritt die Interessen der Arbeitnehmer.

